以上是针对个体而言，接下来就是针对整体了。由于个体的竞争可以给整体带来一定的活力，暂时不必关注个体，因为由于波函数的坍缩总能构建起点和终点的路径，我们有这个自信。因此要考虑整体环境的构建，如经济社会制定一定的法律作为最基本的保障，接下来由个体自由发展，通过如同分子热运动的无限组合，总能得到一些有意义的路径。层次的选择及选择的方法都是选择性表达的结果，是对当前环境的适应。群体的节点的分布符合幂律公式，同时拥有一定的连通性
最后是还原论和整体论的结合，即整合到高维的结构。一沙一世界，个体的信息并非无关紧要，而是相对的比例（个体/整体）小，但信息是全息的，其是一种本征，可扩散为原来的整体网络；由于个体视野的局限和信息流动的限制，根据贝叶斯公式的运算，个体的重要性对个体来说是无限大的，如同心学的无我无世界；于是就有这样的耦合关系：整体网络的坍缩构建个体，个体的无限扩散形成网络。其都是竞争的结果：个体之间，个体和整体之间，整体和整体之间。这个耦合的结构拥有波函数的性质，它总是在正常运行，我们进行观察是只能观察其整体过程的一部分（物理界人称坍缩），即选择性表达。其对环境的适应度很高
相似性，同源性，由于序列的相似性—结构的相似性—功能的相似性
空位罚分是一种匹配的手段，是局部最优的
打分矩阵，替代矩阵
seeds，种子，模式的本征
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